Под любимым Линуксом это делается довольно просто с помощью их API.
Прежде всего устанавливаем пакет ec2-api-tools:
sudo apt-get install ec2-api-tools
Или если его не существует или хотим всегда иметь самую последнюю версию, добавляем репозиторий:
sudo apt-add-repository ppa:awstools-dev/awstools
sudo apt-get update
sudo apt-get install ec2-api-tools
После чего выполняем относительно простые инструкции по установке и настройке EC2 API Tools для Ubuntu.
После этого всего мы готовы к работе с API Amazon’a.
Создаём Security Group (если ещё её не было):
ec2-create-group ips.port80 -d "IP List @ port 80"
GROUP sg-XXXXXXXX ips.port80 IP List @ port 80
И добавляем в неё список IP (при условии что он лежит в файле ~/ips.list, в каждой строке есть отдельный IP или диапазон IP):
for i in `cat ~/ips.list`; do ec2-authorize ips.port80 -P tcp -p 80 -s $i; done
GROUP ips.port80
PERMISSION ips.port80 ALLOWS tcp 80 80 FROM CIDR XXX.XXX.0.0/16 ingress
...
Вот и всё.